Duchovní působil v letech 1990 až 2003 ve farnostech Českobudějovické diecéze, a to v Sudoměřicích u Bechyně, Malšicích, Stádlci a Bechyni jako administrátor excurrendo (dohlížející), v posledním jmenovaném místě působil též jako děkan.

Od roku 2003 užíval zasloužený odpočinek v Klatovech.

Poslední rozloučení s páterem Jaroslavem Karlem se koná v úterý 26. března v 10 h ve farním kostele Narození Panny Marie v Klatovech.